U.C.0088年宇宙卷入了戰亂的漩渦…….

宇宙世紀(U.C.)0079年，人類因人口過剩而移民宇宙已經超過了半過世紀。距離地球最為遙遠的太空殖民地SIDE3宣布獨立，以自護公國之名，對地球聯邦軍展開獨立戰爭。之後被稱為一年戰爭，以地球連邦軍的勝利畫上句號。但是自護軍的餘黨依然潛藏在各地，從事各種反抗活動。

U.C.0083年，為了討伐自護殘黨，特殊部隊泰坦斯因此成立。然而，泰坦斯卻高舉地球至上主義的旗幟，對太空移民展開肅清。

U.C.0087年，對抗泰坦斯的反地球聯邦組織奧幹終於发起軍事行動。同一時期，蟄伏在小行星阿古捷斯的自護殘黨，也為複興自護開始活動了。三股勢力交鋒，隨著U.C.0088的到來，混亂依舊持續……

U.C.0088年2月，由於奧幹的“漩渦作戰”，泰坦斯的王牌----殖民星雷射被奪走，泰坦斯於是向奧幹发動總攻擊企圖奪回殖民星雷射。泰坦斯向來以擁有地球圈最強大之軍事力量為傲，但因為馬沙-阿茲納普的一場演說，舉发了他們以往的殘虐暴行，便失去了政治力量的支持。而因為帕布迪瑪斯-司洛哥暗殺佐米托夫-海曼總帥的行動引发內亂，軍事力量也大幅滑落。此外，覬覦殖民星雷射支配權的阿古捷斯也加入戰局，形成三大勢力的局面，戰火更一发不可收拾。