春假。達也與深雪和朋友們造訪的地點，是雫位於小笠原群島的別墅。原本以為大家可以快樂度假，國防軍卻突然命令達也報到。同一時刻，距離別墅不遠處的南盾島附近海面，正在秘密進行某項魔法實驗……

為了救出囚禁在海軍魔法研究所的少女，達也、艾莉卡、雷歐等三人開始入侵研究所。同一時刻，在家別墅待命的深雪與幹比古，得知莉娜的攻擊造成島上失火。深雪擔心達也的安危，但事態甚至波及全世界，朝意外的方向進展。