日本各地出現邪惡妖怪四處作亂！收到孩子們的求援信，鬼太郎立刻出发降妖除魔！史上最強的妖怪英雄﹁妖怪少年鬼太郎﹂全新原創劇情強勢登台！
東京灣突然出現一座散发強烈妖氣的島嶼。之後，日本全國各地接二連三发生小孩子失蹤的事件。躲在幕後策劃這一切的是西洋妖怪．魔眼太陽！日本妖怪與西洋妖怪火力全開的大決戰即將展開！