《三只眼 幻獸之森的遇難者》是《三只眼》的正統續篇，故事將以宇宙為舞台展開。

擁有不老不死之術的三隻眼吽迦羅少女‧佩，
與她擁有不死身的守護者，變成?的少年‧八雲。
為了實現佩「想變成人類」的願望，
兩人一起踏上冒險的旅程。
但是，那卻是他們跟逼迫人類走向滅亡的破壞神，
展開激烈戰鬥的開始。

然後…一切都結束了。
最終決戰‧桑哈拉結束後12年－－
佩與八雲的全新冒險又揭開了序幕！